▶ 服务介绍
CLIP-qPCR(紫外交联免疫沉淀结合qPCR定量技术)是研究RNA结合蛋白(RBP)与RNA相互作用的重要方法,其核心原理是通过紫外交联与免疫沉淀捕获RNA-蛋白复合物,并结合qPCR进行定量分析。该技术利用365nm紫外光使细胞内RNA与RBP发生共价交联,增强相互作用稳定性,随后通过特异性抗体沉淀复合物,经酶消化(如蛋白酶K、DNase I)后提取RNA,最终通过qPCR对目标RNA结合位点的富集效率进行检测。
▶ 实验步骤
1.紫外交联:细胞经365nm紫外照射,使RNA与RBP形成共价交联。
2.免疫沉淀:利用特异性抗体捕获RBP-RNA复合物。
3.酶消化:通过蛋白酶K、DNase I等去除蛋白和DNA杂质,保留目标RNA。
4.RNA处理:对纯化后的RNA进行3'端加接头,设计位点特异性引物。
5.qPCR定量:通过荧光信号监测目标RNA的富集效率,精确定位结合位点